近日，中国农业科学院西部农业研究中心棉花病害防控与风险评估创新团队通过为期三年的田间试验研究了棉花/芥菜套作对不同生育期的棉花根相关微生物组成和微菌核动态变化规律，揭示了套作重塑根际微生物群落助力棉花抗黄萎病机制。

长期以来，化学农药与土壤熏蒸在土传病害防治中被广泛使用，但这些方法易导致环境污染、破坏土壤微生态，影响农业可持续生产。套作作为一种生态友好的种植模式，逐渐被用于调控土壤微生物群落、提升作物抗病性，然而其内在作用机制尚不清晰。该研究通过高通量测序、可培养微生物筛选及功能验证相结合的方法，系统解析了棉花-芥菜套作模式下土壤微生物群落的结构与功能变化。研究发现，套作显著富集了一批核心有益微生物类群，并基于此构建了一个合成微生物群落（IC-SynCom）。进一步试验表明，IC-SynCom可通过直接拮抗黄萎病菌与激活植物系统抗性双重途径，显著降低棉花黄萎病的发生。该研究系统性地从微生物群落角度阐释了套作增强作物抗病的生态机制，这一发现不仅为棉花的生态化病害管理提供了新思路，也为可持续农业提供了实践依据。

该成果以题为《ntercropping-mediated enrichment of core microbiome enhances suppression of Verticillium wilt in cotton》的研究论文发表于国际权威期刊《环境微生物组（Environmental Microbiome）》（近5年平均IF=6.4）上。

中国农业科学院西部农业研究中心棉花病害防控与风险评估创新团队在读博士生杨传臻、已毕业硕士岳弘辰为该论文共同第一作者，朱荷琴研究员和魏锋副研究员为共同通讯作者。该研究得到了天山创新团队项目（2024D14007）、国家重点研发计划（2022YFD1400300）、新疆天池英才计划（TCYC2023TP02）及国家自然科学基金（31901938）的资助。

原文链接：https://doi.org/10.1186/s40793-025-00840-0

棉花-芥菜套作系统